Proces fermentacji jogurtu zestalonego produkowanego metodą termostatową zachodzi w opakowaniach jednostkowych. Reakcje biochemiczne odpowiedzialne za powstawanie skrzepu są jednak takie same jak w przypadku jogurtu produkowanego metodą zbiornikową.
Jogurt zestalony produkowany metodą termostatową rozlewa się do opakowań, a następnie bez dalszego mieszania poddaje procesowi inkubacji. Dzięki tej metodzie jogurt zyskuje charakterystyczną gęstą zżelowaną konsystencję i idealnie nadaje się do całego szeregu zastosowań. Może być dodatkiem do sosów, curry lub spożywany sam bez żadnych dodatków. Konsystencją i wyglądem jogurt ten przypomina jogurt typu greckiego, jednak z reguły zawiera mniej tłuszczu lub białka.